Digoxigenin (dT) 40 nmol scale

Al igual que la biotina, la digoxigenina (DIG) se utiliza principalmente como una etiqueta no isotópica para el ADN y los oligonucleótidos en una amplia gama de aplicaciones: diagnóstico, secuenciación, aplicaciones de blot e hibridación in situ. La etiqueta de digoxigenina se puede detectar mediante ensayos inmunoenzimáticos para conjugados de proteínas anti-digoxigenina y visualizarse a través de una reacción quimioluminiscente.

La digoxigenina puede incorporarse tanto en ambos extremos como dentro de la secuencia. Eurogentec produce estos oligonucleótidos utilizando un modificador amino, ya sea dT, dR o C6, para crear un sitio de unión para la moiety de digoxigenina. El brazo espaciador entre el nucleótido y la digoxigenina consiste en una cadena de 12 átomos.

De manera similar al método utilizado para la biotina, hemos demostrado que un oligonucleótido etiquetado con 3 moieties de digoxigenina muestra el mejor compromiso entre la estabilidad de hibridación de la cadena, el límite de detección y el costo de la sonda. Al igual que con la biotina, las mejores posiciones para estas tres etiquetas son: una etiqueta en cada uno de los extremos y una interna con al menos 15 bases entre las etiquetas, o 3 en cualquiera de los extremos, cada una separada por el espaciador HEG.

La modificación dR-Digoxigenina (desoxirribosa-Digoxigenina) también permite la síntesis de oligonucleótidos que contienen moléculas sucesivas de digoxigenina en cualquier parte de la secuencia o en cualquiera de los extremos. Cada etiqueta está unida a la desoxirribosa a través de un brazo espaciador de 6 átomos de carbono. Cada dR-Digoxigenina también puede ser separada por un espaciador (normalmente HEG).