5' C6 Psoralen 200 nmol scale

El psoraleno puede ser incorporado solo en el terminus 5’, utilizando un brazo espaciador C2 o C6. El psoraleno se intercalan entre las dos hebras de un dúplex de ADN. Cuando se expone a luz UV de longitud de onda larga, el psoraleno intercalado reacciona con los residuos de timidina para formar un fotoaducto covalente. Cuando se adjunta a un oligonucleótido, el psoraleno forma enlaces cruzados entre hebras. Los fotoaductos pueden ser revertidos por luz UV de corta longitud de onda. La longitud de onda de la luz utilizada para el experimento de enlace cruzado es crítica para obtener el máximo diaducto.

Debido a su relativa hidrofobicidad, los oligos de psoraleno tienen la capacidad de atravesar membranas con relativa facilidad. La derivatización con psoraleno C2 sirve como un reactivo intercalante y de enlace cruzado en oligonucleótidos de doble cadena. El brazo espaciador de 6 átomos del psoraleno C6 permite el enlace cruzado con una hebra de oligonucleótido en triplex.